Keraamika- ja skulptuurikogu
Muuseumi põhikogu moodustab keraamika- ja skulptuurikogu, kuhu kuulub üle 4200 eseme. Kogu täieneb pidevalt ning selle keskmes on Tartu ARSi, selle eelkäijate ja järglaste keraamika, samuti Tartu varasemate savitööstuste toodang.
Maalikogu
Maalikogu eesmärk on tutvustada muuseumis esindatud keraamikute ja kunstnike loomingu mitmekülgsust. Kunstniku looming ei pruugi piirduda ühe materjali või tehnikaga – sama looja võib väljendada end nii savis, maalis kui ka teistes kunstivormides.
Maalikogus on praegu esindatud keraamik Eva Ole maalid ja skulptor Rudolf Lindmäe akvarellid. Maalikogu teosed on osa muuseumi ekspositsioonist.
Tekstiilikogu
Tekstiilikogusse kuuluvad Tartu ARSis valmistatud siiditrükis tekstiilesemed, sealhulgas linikud. Need on jõudnud muuseumi kogusse erinevatel aegadel ning tekstiilikogu sihipärane täiendamine ei kuulu praegu muuseumi peamiste kogumiseesmärkide hulka.
Tekstiilikogu ei ole praegu püsiekspositsioonis.
Arhiivikogu
Arhiivikogu sisaldab muuseumi esemekogu ja uurimistööd toetavaid ning täiendavaid materjale kunstnike, keraamikute ja Tartu savitööstuste kohta. Kogusse kuuluvad muu hulgas kavandid, projektid, fotod ja dokumendid.
Arhiivikogu ei ole praegu ruumipuuduse tõttu püsiekspositsioonis, kuid selle materjale kasutatakse muuseumi uurimistöös.